Rodil se je v Kamniku novembra leta 1599. V jezuitski red je vstopil 7. januarja 1616 v Brnu na Moravskem, kjer je v letih 1617-1618 opravil noviciat. V letih 1622-1623 je bil na dunajskem jezuitskem kolegiju učitelj na humanitetni in gramatikalni stopnji jezuitske gimnazije. Leta 1623 je graški univerzi deloval kot profesor matematike in nato v letih 1624-1627 na isti univerzi študiral teologijo. Leta 1628 je bil poslan v Pleterje in nato naslednje leto v Ljubljano, kjer je ostal do leta 1631. Nato je bil prestavljen v Passau (de), kjer je ostal do 1634. Zadnjih pet let svojega življenja je preživel v Ljubljani, kjer je deloval na jezuitskem kolegiju kot prefetkt šole, spovednik in profesor. Umrl je 9. februarja 1640 v Ljubljani, po dolgotrajni bolezni. Letopis Ljubljanskega kolegija Družbe Jezusove o njegovi smrti poroča: "Prvi je odšel p. Janez Mužan, po rodu Kranjec, v 42. letu starosti in 25. letu v Družbi kot profes štirih zaobljub; mož ni bil le odlično izobražen v višjih vedah, temveč je bil izredno izobražen tudi v matematiki in humaniteti. V neprestani borbi z jetiko je zadovoljivo opravljal službo šolskega prefekta, bil je ljub našim in zunanjim. [...]"
Vnos: AK